Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf5P70191 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms