Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms