Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rps29P62274 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms