Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csrnp3P59055 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms