Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms