Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms