Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms