Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms