Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp5P56399 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms