Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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