Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnt2P50752 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnt2P50752 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnt2P50752 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnt2P50752 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnt2P50752 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnt2P50752 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnt2P50752 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms