Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpreP49446 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpreP49446 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PtpreP49446 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpreP49446 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PtpreP49446 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PtpreP49446 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PtpreP49446 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PtpreP49446 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PtpreP49446 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpreP49446 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PtpreP49446 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PtpreP49446 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PtpreP49446 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpreP49446 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtpreP49446 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms