Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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Rpl28P41105 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
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Rpl28P41105 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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Rpl28P41105 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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Rpl28P41105 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
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