Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VhlP40338 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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VhlP40338 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VhlP40338 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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