Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms