Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtlP38585 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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TtlP38585 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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TtlP38585 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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TtlP38585 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms