Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig1P37913 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms