Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptpn11P35235 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms