Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp4P35123 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp4P35123 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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