Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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