Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pabpc1P29341 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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