Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcdP28867 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms