Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RxraP28700 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxraP28700 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxraP28700 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms