Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Atxn10P28658 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atxn10P28658 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atxn10P28658 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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