Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PdgfraP26618 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms