Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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