Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6bP23440 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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