Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ggta1P23336 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ggta1P23336 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ggta1P23336 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ggta1P23336 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ggta1P23336 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ggta1P23336 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms