Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PparaP23204 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PparaP23204 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PparaP23204 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PparaP23204 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PparaP23204 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PparaP23204 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PparaP23204 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PparaP23204 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PparaP23204 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PparaP23204 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PparaP23204 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PparaP23204 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PparaP23204 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PparaP23204 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PparaP23204 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PparaP23204 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PparaP23204 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PparaP23204 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PparaP23204 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms