Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms