Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms