Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms