Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NefhP19246 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
NefhP19246 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NefhP19246 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NefhP19246 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NefhP19246 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NefhP19246 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NefhP19246 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NefhP19246 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NefhP19246 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NefhP19246 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NefhP19246 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms