Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms