Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhoP15409 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RhoP15409 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RhoP15409 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RhoP15409 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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