Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms