Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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