Protein–RNA interactions for Protein: P11276

Fn1, Fibronectin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fn1P11276 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Fn1P11276 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Fn1P11276 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Fn1P11276 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Fn1P11276 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Fn1P11276 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Fn1P11276 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Fn1P11276 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fn1P11276 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms