Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc6P10629 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hoxc6P10629 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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