Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms