Protein–RNA interactions for Protein: P0DP60

Lynx1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lynx1P0DP60 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lynx1P0DP60 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lynx1P0DP60 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms