Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms