Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxa4P06798 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
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