Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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