Protein–RNA interactions for Protein: P01898

H2-Q10, H-2 class I histocompatibility antigen, Q10 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q10P01898 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms