Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CopeO89079 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CopeO89079 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CopeO89079 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CopeO89079 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CopeO89079 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CopeO89079 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms