Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcnkO88874 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CcnkO88874 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms