Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AurkcO88445 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms