Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfdp1O88271 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms