Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms